2012-2016年，动物所共承担国家重要科技项目、国家自然科学基金项目、院先导专项等重要科技任务959项。 

　　国家重要科技项目，包括：973项目（课题、子课题）47项、863项目（课题、子课题）5项、科技支撑项目（课题、子课题）9项，转基因重大专项（课题、子课题）8项，国家重点研发专项(课题、子课题)63项、基础性工作专项7项、重大行业专项（课题、子课题）8项。 

　　国家自然科学基金项目，申请891项，获得资助394项，资助率为44.2%，远超本领域自然基金项目的平均资助率。项目共包括创新研究群体科学基金1项，国家杰出青年科学基金6项，优秀青年科学基金项目13项，重大项目2项、重点项目15项，重大研究计划重点项目2项，重大研究计划集成项目6项，重大研究计划培育项目4项、基础科学人才培养基金项目1项、重点国际合作研究项目10项，组织间国际合作研究项目4项，海外及港澳学者合作研究基金1项，面上项目206项，青年科学基金项目86项。 

　　中科院项目（课题），112项，其中包括主持先导专项（A类）和（B类）各1项。承担先导专项（A类）课题5项，承担先导专项（B类）课题13项， STS项目（课题）8项，重点部署项目（课题）26项，院战略生物资源项目（课题）11项，院国防科技创新基金项目1项。 

　　国际合作项目，40余项，包括：院对外合作重点项目3项、院“一带一路”专项2项、国际大科学培育专项1项、院东南亚中心项目3项、外方资助的国际合作项目23项以及其他类型的相关项目10项。 

　　横向课题，316项，包括承担高校及医疗机构委托17项，承担各级政府委托规划咨询、评估调查及省院合作等项目138项，承担科研机构委托服务60项，为企业提供技术开发和技术服务101项。